Responsável (para o projeto Genoma EST camarão): Dr. Silvia Regina Batistuzzo de Medeiros

Equipe: Dr. Lucymara Fassarella Agnez Lima, Dr. Magnólia Fernandes Florêncio de Araújo, Dr. Rosely de Vasconcellos Meissner, Dr. Wagner Franco Molina, Dr. Francisco de Assis Maia de Lima

O Laboratório de Biologia Molecular e Genômica iniciou suas atividades na UFRN em 1998 com o grupo de mutagênese. Atualmente as pesquisas se concentram na área de mutagênese e reparo de DNA. Nossas atividades envolvem análises do potencial genotóxico/mutagênico de produtos naturais, fármacos e agentes oxidativos, através da utilização de testes in vitro e in vivo. Além disto, temos interesse também nas vias de reparo de DNA envolvidas na correção dos danos gerados. Recentemente, com a aprovação de um projeto no último edital do CT-hidro/CNPq, nossos estudos de mutagenicidade começam a abranger também a questão ambiental, visto nosso interesse em determinar a presença de agentes genotóxicos/mutagênicos nas águas do rio Potengi, Pitimbú e de parte do Aqüífero Barreiras. Para tanto, além de testes em procariotos como teste de Ames e SOS cromoteste, utilizaremos ensaios em eucariotos como o teste do Cometa, análise citogenética e de assimetria flutuante em peixes que vivem nos ambientes em estudo.

Em maio de 2000, iniciou-se nossa experiência com a genômica visto que nosso grupo foi selecionado para integrar a rede do Projeto Genoma da cana-de-açúcar (Sugarcane Expressed Sequence Tag - SUCEST) como um dos laboratórios de data-mining. Nosso interesse concentrou-se nos genes de reparo da via de excisão de bases. Neste projeto, identificamos seqüências de cana com homologia a glicosilases e AP endonucleases. No momento, temos no laboratório 19 clones que são alvos de análises estruturais, evolutivas e funcionais. Em continuidade a este trabalho, no início de 2002 fomos selecionados, em edital aberto pelo Laboratório Nacional de Luz Síncrotron/MCT, para integrar a Rede Nacional de Biologia Molecular Estrutural com o objetivo de caracterizar a estrutura das proteínas de reparo estudadas.

Em dezembro de 2000 fomos selecionados para integrar a Rede Nacional de Seqüenciamento Nucleotídico e participamos de todas as etapas do genoma da Chromobacterium violaceum no que diz respeito ao: seqüenciamento de clones, construção de biblioteca de cosmídeo, fechamento de gaps, montagem do mini-genoma de cosmídeo e anotação do genoma da C. violaceum. Atualmente, estamos concluindo a parte do seqüenciamento do genoma da Mycoplasma sinovisae para iniciar a anotação e algumas estratégias para o fechamento de possíveis gaps.